Ежедневно появляются огромные объемы биологических данных, ожидающих своей расшифровки. Практически невозможно их проанализировать и визуализировать без написания сложного кода. Как биолог, возможно, вы не сочтете оптимальным использовать свое время для разработки такого кода с нуля.

Вот почему мы создаем BioVinci, мощный, но простой инструмент для анализа и визуализации данных. BioVinci позволяет биологам из влажных лабораторий и биомедицинским исследователям обрабатывать данные на привычном экране. Никакого вычислительного фона не требуется. Просто перетащите. Это так просто.

С помощью BioVinci вы можете:

  • Настройте свои сюжеты и быстро подготовьте их к публикации,
  • Изучите свои данные с помощью последних достижений в области машинного обучения,
  • Выполняйте любой статистический анализ, от простого до сложного.

BioVinci теперь доступен как в веб-версии, так и в версии для приложений. Попробуйте это: https://vinci.bioturing.com/

Эта запись в блоге познакомит вас с основами BioVinci. Вы удивитесь, насколько это просто.

Домашний экран

Вы попадете на главный экран после запуска приложения. Здесь вы можете импортировать свои данные, получить доступ к примерам и перейти к ранее сохраненным и совместно используемым графикам.

(1) Контроллер рабочего листа позволяет просматривать примеры, сохраненные проекты и ранее опубликованные графики. На рис. 1 показан пример вкладки галереи. Вы можете запустить эти примеры, чтобы увидеть, как структурировать и вводить данные.

(2) Кнопка «Импорт данных» позволяет вручную вводить данные или загружать весь набор данных (поддерживаемые форматы файлов включают CSV, TSV и Excel).

(3) Документация позволяет получить доступ к полному руководству по функциям BioVinci.

Ввод данных

Нажмите Импортировать набор данных в главном окне или на любом графике в галерее примеров.

Вы можете загрузить свой файл (CSV, TSV или Excel) или ввести данные вручную (см. Рисунок 2). Данные должны быть структурированы в виде таблицы (или матрицы). Для Excel и аналогичных редакторов рабочих листов вы должны удалить все ненужные заголовки и информацию и просто загрузить основную таблицу в BioVinci.

(1) Заголовок рабочего набора: это поле обязательно для заполнения, иначе вы не сможете перейти к следующей странице.

(2) Первая строка как заголовки: проверьте, соответствует ли первая строка заголовкам столбца.

(3) Количество репликаций: если ваши данные содержат объединенные метки столбцов, которые показывают репликации в вашем эксперименте, вы должны ввести количество репликаций, чтобы BioVinci мог понять ваши данные. . Подробнее об этом в нашем блоге.

(4) Область импорта: где вы можете вводить и редактировать свои данные.

(5) Найдите файл для загрузки: просмотрите свою таблицу, если вы не хотите вводить данные вручную.

Интерфейс проекта

(1) Панель инструментов показывает доступные функции для вашего проекта .

  • Добавить данные: введите новый набор данных отдельно от текущего . Новые импортированные данные появятся на панели данных (2).
  • Редактировать данные: редактировать свои данные
  • Создание переменных: создайте соответствующую матрицу, включающую только некоторые столбцы из исходной таблицы, для выполнения функций статистического и машинного обучения.
  • Изменить график: откройте режим редактирования, в котором вы можете настроить параметры графика.
  • Очистить график: очистите все входные данные на панели ввода (3) и области графика (4).
  • Сохранить / Удалить: сохранить текущий график в панели галереи (5). Если сюжет уже был в этой галерее, кнопка будет иметь вид Удалить.
  • Экспорт: экспорт данных в различных форматах (SVG, PNG и PDF для изображений и CSV для статистических результатов).
  • Статистические результаты: эта кнопка появляется только при использовании статистических функций. На рисунке 3 в качестве иллюстрации показана основная графическая функция.
  • Предложения (справа): вы можете навести указатель мыши на миниатюру, чтобы увидеть, какие статистические данные предлагает BioVinci для ваших данных, и нажмите, чтобы применить ее, если хотите.

(2) Панель данных: показывает структуру ваших данных в виде названий столбцов. Если метки не указаны, BioVinci установит их как X1, X2 и т. Д. Крошечный рисунок слева от каждой метки показывает тип столбца. Первые два столбца (Часы и Фактор2) являются категориальными столбцами, а последний (Значение) - числовым.

Вы можете переключиться на вновь созданные переменные в раскрывающемся списке (показан как Лист 0 на рисунке 4).

(3) Панель ввода: перетащите данные с панели данных (2) на заполнители, чтобы создать графики или запустить анализ. Панель ввода отличается для каждой функции. Перетаскиваемые элементы включают столбцы и матрицы.

(4) Область построения: здесь появляется ваш график. Некоторые статистические результаты могут иметь более одного графика. В этом случае в области графика отображается только первый график. Пользователи могут переключаться на разные графики с помощью раскрывающегося списка в крайнем левом углу панели значков графика (6).

(5) Панель галереи: представляет все сохраненные графики / результаты текущего проекта. Вы можете щелкнуть миниатюру, чтобы открыть сохраненный график / результат.

(6) Значки типа графика: выделите текущий тип графика и покажите все возможные типы графика. Вы также можете контролировать размер и тему графиков. В BioVinci есть различные настройки, с помощью которых можно быстро подготовить график к публикации.

Более подробная информация

Посетите наш блог или свяжитесь с нами по адресу [email protected]. Любой вопрос приветствуется. Мы здесь, чтобы помочь.

Подпишитесь, чтобы оставаться в курсе.